一、非法营运的车辆怎么处理

对于存在非法营运行为的机动车辆，法定机关应自县级以上的级别进行处置，由道路运输管理机构下达相应的行政命令予以制止；若该行为涉及违法所得，则应当依法予以追缴并没收，同时处以违法所得2倍以上至10倍以下的罚款；而如果没有违法所得，或者违法所得不足以达到1万元的标准，则将面临2万元以上至5万元以下的罚款处罚；如情节严重，构成犯罪的，还需依法追究其刑事责任。

《道路运输条例》第六十五条

违反本条例的规定，未经许可擅自从事道路运输站（场）经营、机动车驾驶员培训的，由县级以上道路运输管理机构责令停止经营；

有违法所得的，没收违法所得，处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足1万元的，处2万元以上5万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

从事机动车维修经营业务不符合国务院交通主管部门制定的机动车维修经营业务标准的，由县级以上道路运输管理机构责令改正；情节严重的，由县级以上道路运输管理机构责令停业整顿。

从事机动车维修经营业务，未按规定进行备案的，由县级以上道路运输管理机构责令改正；拒不改正的，处5000元以上2万元以下的罚款。

二、非法营运车辆发生交通事故的责任主体

非法营运车辆发生交通事故的责任判定如下：1、非法营运并不意味着一定会导致交通事故的发生；2、此外，非法经营和交通事故侵犯的法律利益是不一样的；3、因此，在非法运营车辆在交通肇事中在事故责任认定中与普通车辆一样，只追究其对违章道路交通安全法的责任，非法运营是运管部门进行处罚管理的，与交通事故处理无关。

《中华人民共和国道路交通安全法》第二十二条机动车驾驶人应当遵守道路交通安全法律、法规的规定，按照操作规范安全驾驶、文明驾驶。饮酒、服用国家管制的精神药品或者麻醉药品，或者患有妨碍安全驾驶机动车的疾病，或者过度疲劳影响安全驾驶的，不得驾驶机动车。任何人不得强迫、指使、纵容驾驶人违反道路交通安全法律、法规和机动车安全驾驶要求驾驶机动车。

在我们日常生活中，法律是一种无形的约束，它既保护我们的权益，也规范我们的行为。无论是在工作中，还是在生活中，我们都需要充分了解和理解法律，以便更好地保护自己的权益。虽然法律可能看起来复杂和深奥，但是只要我们愿意花时间去学习和理解，就能够掌握它的基本原理和应用。正如本文的标题所提出的问题，“非法营运的车辆怎么处理”，每一篇文章都是一次学习和理解法律的机会，我们应该抓住这些机会，不断提高我们的法律素养，以便更好地适应社会的发展和变化。