民事诉讼案件、刑事自诉案件和行政赔偿诉讼的案件，已经确立了调解的基本制度，即当事人在合法、自愿的原则下进行调解，这给行政诉讼的调解提供了很好的借鉴。行政案件的调解，也可以借鉴上述案件调解的程序。

(一)调解的时机。原则上判决前的任何诉讼阶段均可进行，特别是在证据交换或庭审后，被诉具体行政行为的合法性往往一目了然。此时适时调解，原、被告双方抵触情绪较小，容易促其和解。

(二)适用调解的案件如果涉及到第三人的利益，如行政裁决案件，法院应依申请或依职权通知第三人参加诉讼，特别是不能忽视国有资产管理者和经营者，参加到诉讼中来，以保证第三人的利益不受侵犯。

(三)在涉及到民事方面的调解时，要把行政诉讼的证据规则与民事诉讼的证据规则有机结合起来，以便更好地查情案件事实，分清责任，为调解打好基础。

(四)将调解确定为法定的结案方式。在行政诉讼中，人民法院可以调解笔录或当事人的调解协议进行结案，如果是以调解方式结案的话，人民法院可以制作“行政调解书”。