1.犯罪主体不同。为亲友非法牟利罪的主体是国有公司、企业、事业单位的工作人员，这里的工作人员不仅仅指国有公司、企业、事业单位的国家工作人员，也不仅仅指董事、监事、经理等管理层人员，而是泛指国有公司、企业、事业单位的所有工作人员。而非法经营同类营业罪的主体是国有公司、企业的董事和经理，范围要小很多。

2.客观方面不同。为亲友非法牟利罪在客观方面表现为利用职务便利，将本单位的盈利业务交由自己的亲友经营，或者以明显高于市场的价格向自己的亲友进行经营管理的单位采购商品或者明显低于市场的价格向自己的亲友经营管理的单位销售商品，或者向自己的亲友经营管理的单位采购不合格商品。非法经营同类营业罪在客观方面则表现为行为人利用职务便利，为自己经营或者为他人经营与其所任职公司、企业同类的营业，获取非法利益。

3.犯罪结果要求不同。为亲友非法牟利罪的犯罪结果为使国家利益遭受重大损失，而非法经营同类营业罪的犯罪结果为行为人获取非法利益数额巨大。

数额是否巨大不是构成为亲友非法牟利罪的必要要件，因为对应法条中并无行为人非法获利及其数额大小的规定，而只有行为人利用职务便利，实施背信经营行为，使国家利益遭受重大损失或特别重大损失的规定。

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