睾丸微痛可能因为睾丸炎症引起，或者睾丸损伤导致。细菌通过尿路感染逆行到附睾以及睾丸而引起感染也可导致睾丸疼痛。如果是损伤引起睾丸疼痛，则疼痛部位有淤血，在运动剧烈的时候疼痛感加重，并且使得提睾肌收缩强烈。睾丸突然被扭转也可导致疼痛。睾丸微痛时男性性欲可降低。

睾丸微痛常在重体力劳动后发生，如举扛重物后等，也可以在较强烈的性兴奋后出现。除此之外，经尿道器械操作所致的损伤可导致附睾炎，前列腺摘除术后也可并发附睾炎。

因尿道留置导管和尿道内器械检查诱发前列腺感染，及伴发急性附睾炎也可导致睾丸微痛。无菌尿返流进输精管可导致化学性附睾炎都能引发睾丸疼痛。

急性附睾炎常继发于前列腺炎，阴囊内睾丸疼痛常突然发生，可沿精索放射至腹股沟区及腰骶部，疼痛通常较重，触压时疼痛明显加剧。同时，肿胀进展较快，可在3~4小时内使附睾体积增大一倍，体温可达40℃左右，尿道内可有分泌物出现，此时可伴有膀胱炎，尿液混浊。

临床上附睾炎患者会出现睾丸隐痛的症状，疼痛并向腹股沟放射，有明显的下坠感觉，还同时有高热、恶心、呕吐、白细胞升高等，同时睾丸肿大、隐痛非常明显，阴囊皮肤红肿。检查时附睾常有不同程度的增大变硬。有轻度压痛，同侧输精管可增粗。

睾丸微痛对患者危害大，能够使得患者生育能力丧失，还可诱发精索静脉曲张、前列腺炎等疾病。睾丸轻微疼痛可怀疑为恶性肿瘤。这种疼痛如果是因为炎症长期刺激引起，则可在男性射精时疼痛加重，严重影响到夫妻生活质量。