在月经期间，女性阴道内酸度有所降低，身体的免疫力会降低易感染病菌，经期同房会将细菌带入阴道，引起子宫内膜炎，子宫肌炎，输卵管炎，卵巢炎等妇科疾病，严重时可导致女方不孕。

月经来潮时，盆腔充血会引起腰腿酸、下腹部胀痛或不适，此时若有性生活，势必会增加不适的感觉。女性生理期间子宫收缩会加速原来疼痛的感觉，若是此时发生性行为，男性在女性体内射精，由于精液里面有前列腺素，会导致子宫收缩更严重，比较可能产生痉挛的状况。另外，由于此时子宫内膜剥落，经血是往下流的，发生性行为产生撞击会让经血逆流，有可能产生子宫内膜异位的状况，而且此时容易感染、发炎，所以不建议在此时发生性行为。同时经期同房还可能使月经分泌物进入男性尿道引起尿路感染。