一、自然人转让上市公司股权的税收有哪些?

1、印花税

在股权转让的时候是需要签股权转让合同或协议的，按照我国法律规定交易合同是需要贴花缴纳印花税的。印花税是对签订股权转让合同的双方征收的，双方都需要缴印花税。

注意：印花税是由股权转让双方来支付的，不是被投资的企业。

税率：万分之五

计算公式：应纳印花税额=合同所载金额总额*5/10000

印花税可以按次申报也可以就按时间段汇总后统一申报。

一般个人或个体工商户都是按次申报，即签完一份合同后，带着合同去主管地税局办理。

而增值税纳税人可以根据自己的增值税申报周期申报印花税，即若你是一个月申报一次增值税，那也一个月申报一次印花税，若你是一个季度申报一次增值税，那也一个季度申报一次印花税。

2、增值税

在股权转让过程中，分为好几种情况，我们通过一张表格图片来说明哪些情况需要交增值税，哪些情况不需要交增值税

从上图我们可以看出只有企业转让上市公司的股权才需要按照金融商品转让缴纳相应增值税。

而金融商品转让的增值税税率，一般纳税人为6%，小规模纳税人为3%。

3、企业所得税

股权转让的税收中，增值税针对上市公司，印花税是小头，占大头的也是大家最关心的是所得税。但是所得税根据转让双方的情况分为下列几种：

持股主体是企业，转让给个人

持股主体是企业，转让给企业

持股主体是个人，转让给个人

持股主体是个人，转让给企业

(1)、持股主体为企业的需要缴纳企业所得税，税率：25%(由于政策税收优惠，符合条件的小型微利企业，企业所得税税率是20%，高新技术企业，企业所得税税率为15%)

计算公式：企业应纳所得税额=(转让股权收入-取得该股权所发生的成本-转让过程中所支付的相关合理费用)*25%

注意：实务中，转让方股权转让所得的认定是一个很麻烦的问题，要厘清股息、未分配利润等等，我就不一一介绍了。

(2)、持股主体个人需要缴纳个人所得税。税率：20%

计算公式：个人应纳所得税额=(转让股权收入-取得该股权所发生的成本-转让过程中所支付的相关合理费用)*20%。

以上就是自然人转让上市公司股权的具体税收情况，由于转让股权涉及到公司的重大事项变动，是需要按照法律规定的程序来召开股东大会判决的，如果对相关情况的处理和认定不清楚的，可以咨询当地的税务部门来进行认定。