建设工程合同诉讼时效为三年，从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。如果有以下情形之一的，则诉讼时效中断，诉讼时效期间从中断、有关程序终结时起重新计算：1、权利人向义务人提出履行请求；2、义务人同意履行义务；3、权利人提起诉讼或者申请仲裁；4、与提起诉讼或者申请仲裁具有同等效力的其他情形。

　　建设工程施工合同纠纷处理方法

　　１、严格招投标和承发包程序，优选施工单位，严格控制工程分包和转包。

　　２、建设前期加强立项管理，打足投资，保证归口使用资金８０％以上存入银行，专款专用。

　　３、加强合同和信息管理，签定协议尽量采用规范的合同示范文本，对附加条款要仔细推敲，咨询有关专家，请专家给予指导。

　　４、严格进行工程变更把关，严禁通过设计变更扩大建设规模，增加工程内容，提高建设标准，对必须变更的，应先做工程量和造价增减分析。

　　５、加强隐蔽工程的检查验收，完善隐蔽工程现场签证手续。

　　６、及时解决工程中的索赔问题。

　　７、结算时，力争不漏算，不错套定额，不乱取费，并委托具有资质的造价咨询机构进行结算、委托资深望重的造价工程师主持结算工作。

　　８、进一步规范业主、承包商、政府行政管理部门的行为，不瞎指挥。

　　法律依据

　　《中华人民共和国民法典》第一百八十八条：向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

　　《中华人民共和国民法典》第一百三十七条：诉讼时效期间从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。但是，从权利被侵害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。有特殊情况的，人民法院可以延长诉讼时效期间。

　　《中华人民共和国民法典》第一百三十八条：超过诉讼时效期间，当事人自愿履行的，不受诉讼时效限制。