因为法院的判决书从生效后即产生法律效力。虽然实质上男方起诉离婚不符合法定程序，但是，准予离婚的判决书已经解除了二人的夫妻关系，具有公信力。

撤销判决恢复他们的夫妻关系没有法律依据。根据《民事诉讼法》第一百八十三条的规定，当事人对已经发生法律效力的解除婚姻关系的判决，不得申请再审。女方只能通过与男方协商解决怀孕的问题，否则另案起诉。