根据国务院1991年第87号令《全民所有制企业招用农民合同制工人的规定》，农民工因工负伤，由企业给予免费医疗。医疗期间，农民工原标准工资照发。医疗终结经医院证明，并经劳动鉴定委员会确认不能从事原工作的，送回农村妥善安置，由企业按下列办法发给因工致残抚恤费：
(1)完全丧失劳动能力的，按照城镇合同制工人的抚恤费标准，按月发给，直至死亡;
(2)大部分丧失劳动能力的，按照农民工原标准工资的70%，按月发给，直至死亡;
(3)部分丧失劳动能力的，根据其伤残程度一次性发给。具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定。农民工患职业病的，其医疗和生活待遇，与城镇合同制工人相同。
但是随着我国社会主义市场经济体制的逐步建立，农民大量进入城市从事劳动密集型行业工作，特别是煤矿企业，目前从业人员基本上是农民工。目前，煤矿每年的死亡人数接近6000人，基本上都是农民工。农民工死亡的赔偿标准因各地的经济发展、地方的财政政策和企业的经营状况的不同而有所区别。
为规范工伤认定程序，依法进行工伤认定，维护当事人的合法权益。2003年9月18日劳动和社会保障部颁布《工伤认定办法》、《非法用工单位伤亡人员一次性赔偿办法》、《因工死亡职工供养亲属范围规定》，自2004年1月1日起施行。