仲裁时效的性质虽与诉讼时效存在一致性，但由于在具体法律规定上略有不同，二者在适用上存在差异。

相同处：(1)都是指权利不行使并达到一定期间而丧失法律保护的制度。(2)都是指丧失胜诉权而未丧失诉权。(3)除斥期间届满后该项实体权利消灭(仲裁时效届满后，当事人虽仍可向人民法院提出诉讼，但其于仲裁部门的实体权利消灭)。

不同处：(1)仲裁时效固定为60日;诉讼时效则包含普通诉讼时效、特殊诉讼时效和最长诉讼时效，不同的时效期间各不相同。(2)仲裁时效中未规定时效中止、中断的条件，诉讼时效明确规定了时效中止、中断的条件。(3)仲裁委员会可依据审查结果主动适用时效规定，人民法院则非依义务人主张，不得主动适用诉讼时效。(4)当事人因不可抗力或者其他正当理由超过规定申请仲裁时效的，仲裁委员会还应当受理，即仲裁时效为可变期间。而诉讼的除斥期间为不变期间，不因任何事由而中止、中断、延长。