根据《劳动合同法》的规定，保密协议中不得直接设定违约金，若约定违约金存在被认定为无效的风险。但这并不意味着保密协议中不可约定违约责任，保密协议中可约定违反保密义务的赔偿内容以及计算赔偿数额的方式。

商业秘密违约金对应的是商业秘密侵权所导致的损失，对商业秘密违约金的约定可以采用两种方式：

一是采用惩罚性违约金约定，可以按照略高于预期损失的方式确定违约金的具体数额;

二是约定因商业秘密违约产生的损失赔偿的计算方式，如因客户信息的泄露造成销售额度的减少，可以销售额的减少数额作为违约金的计算方式。

按照规定，保密协议中不能直接设违约金，如果存在违约金的会被认定为无效合同。商业秘密违约条款中的违约金约定方式有两种，一种是采用惩罚性违约金约定，另一种是以商业秘密违约产生的损害赔偿来计算。

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